原文標(biāo)題:Epidemiological investigation and analysis of the infection of porcine circovirus in Xinjiang
本研究的目的是了解新疆地區(qū)豬圓環(huán)病毒(porcine circovirus, PCV)的分布,同時分析PCV2和PCV3的遺傳多樣性。本研究自2022年8月至2024年1月,從新疆8個區(qū)域的22家豬場采集有呼吸窘迫、繁殖障礙的臨床表現(xiàn)及因腹瀉導(dǎo)致消瘦的豬的血液、肺、肝臟和淋巴結(jié)合計(jì)453份樣本。經(jīng)qPCR檢測四種PCV的陽性率,并對部分PCV2和PCV3陽性樣本進(jìn)行測序分析和系統(tǒng)發(fā)育分析。
結(jié)果顯示,PCV1、PCV2、PCV3和PCV4的陽性率分別是15%、71%、25%和17%(圖 9a),各PCV混合感染情況如圖9b,PCV2和PCV3混合感染率最高,達(dá)12.36%。

對PCV2的ORF2測序結(jié)果顯示,分析的9個PCV2的序列分別屬于PCV2e(1條)、PCV2b(4條)和PCV2d(4條)(圖10a),9個ORF2序列間核酸相似度從81.8%至94.8%之間。氨基酸序列分析結(jié)果顯示,相對于其他亞型,PCV2b和PCV2d均在抗原識別區(qū)發(fā)生了3個突變,除此之外PCV2b在NLS-B位點(diǎn)還有一個突變。本研究中測序的PCV2e相對于其他亞型也有2個氨基酸突變,與主要毒株P(guān)CV2d的抗原表位存在顯著差異。
12條PCV3的ORF2序列分析顯示,2條為PCV3a,10條為PCV3b(圖10b),它們的相似性在95.5%至97.1%之間。氨基酸分析顯示,PCV3a相對其他亞型有3個氨基酸突變,而PCV3b有4個突變。

來源:Virology Journal